表型是指基因型和環(huán)境決定的形狀、結(jié)構(gòu)、大小、顏色等生物體的外在性狀。表型組又是指某一生物的全部性狀特征，不僅僅局限于農(nóng)藝性狀，還應(yīng)更加關(guān)注植株所表現(xiàn)出來的生理狀態(tài)。隨著多數(shù)代表植物全基因組測序的結(jié)束，科研人員越來越認(rèn)識到植物表型研究的重要性，并將其提到的“組學(xué)”的高度。植物表型組學(xué)是研究植物的生長、表現(xiàn)和組成的科學(xué)，它的研究可以從小至核苷酸序列細(xì)胞，大至組織、器官種屬群體的表型來研究分析，并且可以進(jìn)一步整合到基因組學(xué)研究中；而從系統(tǒng)生物學(xué)角度來看，從基因組到轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組以及表型組，表型組是各種組的表現(xiàn)形式。因此，植物表型組學(xué)的研究將是涉及植物各個方面的研究領(lǐng)域。

　　植物表型參數(shù)的分析與育種息息相關(guān)。傳統(tǒng)的表型數(shù)據(jù)的獲取主要是通過手工測量和照相后軟件分析進(jìn)行。手工測量可以獲取植物直徑、葉長、葉片數(shù)目等指標(biāo)，照相后軟件分析或通過葉面積儀可以獲取植物的葉長、葉寬、葉面積、葉傾角等指標(biāo)。這些測量都需要花費大量時間，測量結(jié)果準(zhǔn)確性較低，工作繁瑣，工作量大，這些缺點大大限制了大規(guī)模遺傳育種篩選的效率。此外，國內(nèi)目前采用的這些傳統(tǒng)方法都只能獲得植物表型的部分指標(biāo)，優(yōu)良株型的選擇等也只能依靠科研人員經(jīng)驗選擇，而每個人的選擇標(biāo)準(zhǔn)不同，甚至差異很大，造成沒有辦法統(tǒng)計。鑒于大量的植物表型組學(xué)數(shù)據(jù)，表型信息的聯(lián)用對功能基因組學(xué)的研究意義巨大，必須要依托準(zhǔn)確科學(xué)的高通量植物表型平臺去完成工作。