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    FluorCam多光譜熒光成像技術(shù)應(yīng)用案例——植物病害表型研究

    發(fā)布時(shí)間: 2020-05-19  點(diǎn)擊次數(shù): 2034次

    1. 植物病害早期快速無損檢測(cè)

    由于次生代謝產(chǎn)物如多酚等與植物的病害脅迫應(yīng)答機(jī)制緊密相關(guān)。因此初,F(xiàn)luorCam多光譜熒光成像技術(shù)主要用于植物病害早期快速無損檢測(cè),希望能在病害產(chǎn)生嚴(yán)重影響前就能發(fā)現(xiàn)感染(圖4)。      image.png           圖1. UV-MCF多光譜熒光成像早期研究,左:煙草花葉病毒感染的多光譜熒光連續(xù)觀測(cè)(Chaerle,2006);右:辣椒輕斑駁病毒感染早期的多光譜熒光分析(Pineda,2008)

    隨著研究的不斷深入,科學(xué)家們將多光譜熒光成像與葉綠素?zé)晒獬上?、紅外熱成像、以NDVI歸一化植被指數(shù)為代表的反射光譜成像等其他表型分析技術(shù)結(jié)合,開展了更深入的植物病害檢測(cè)和表型研究工作。

    德國(guó)萊布尼茨蔬菜和觀賞植物研究所IGZ致力于通過這些成像分析技術(shù)發(fā)展一種能夠高通量快速檢測(cè)生物脅迫的方法。他們使用了一種模式植物-病原體系統(tǒng)生菜-立枯絲核菌(Rhizoctonia solani),希望通過這幾種技術(shù)獲得的數(shù)據(jù)能夠快速將受到生物脅迫和未受到脅迫的植株區(qū)分開(Sandmann,2017)。

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    圖2. 生菜-立枯絲核菌的NDVI成像圖與熱成像圖

    由于這幾種技術(shù)的原理不盡相同,類似的研究中經(jīng)常需要使用多種儀器才能完成。而FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng)是目前*有能力實(shí)現(xiàn)了一臺(tái)儀器上同時(shí)完成葉綠素?zé)晒?、多光譜熒光、NDVI歸一化植被指數(shù)以及GFP、YFP、BFP、RFP、CFP、DAPI等熒光蛋白與熒光染料的成像分析功能,加裝熱成像模塊后還可以進(jìn)行熱成像分析。這些功能使得FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng)就成為了一套功能非常全面的植物病害表型研究系統(tǒng)。

    通過數(shù)據(jù)分析終發(fā)現(xiàn)葉綠素?zé)晒鈪?shù):PSII大量子產(chǎn)額Fv/Fm和熒光衰減比率Rfd的區(qū)分效果好,誤差≤0.052。研究者希望通過進(jìn)一步工作,將這一發(fā)現(xiàn)應(yīng)用于園藝和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)實(shí)踐。

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    圖3. FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng)測(cè)量的各項(xiàng)表型參數(shù)及分析數(shù)據(jù)結(jié)果

    2. 葉片病害

    細(xì)菌性軟腐病菌Dickeya dadantii是農(nóng)業(yè)上的重要病害。這種病菌會(huì)先圍繞一個(gè)萎黃環(huán)出現(xiàn)多個(gè)壞死斑點(diǎn),進(jìn)而整個(gè)感染區(qū)域壞死并逐漸擴(kuò)展到周圍的組織中。FluorCam葉綠素?zé)晒獬上瘛luorCam多光譜熒光成像、熱成像可以在時(shí)間和空間尺度上分別反映細(xì)菌感染對(duì)光合作用、初級(jí)和次級(jí)代謝和氣孔活性的影響。西班牙國(guó)家研究委員會(huì)(CSIC)使用這三種技術(shù)對(duì)甜瓜葉感染Dickeya dadantii進(jìn)行了成像測(cè)量,同時(shí)通過機(jī)器學(xué)習(xí)來處理這些成像技術(shù)獲得的數(shù)據(jù),建立數(shù)學(xué)算法來分類葉片感染區(qū)域(Pineda, 2018)。

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    圖4. 甜瓜葉感染Dickeya dadantii不同時(shí)期的葉綠素?zé)晒獬上?、多光譜熒光成像和熱成像圖

    根據(jù)成像圖獲得的葉綠素?zé)晒夂投喙庾V熒光定量數(shù)據(jù)

    除病毒和細(xì)菌外,真菌引起的植物葉片病害也有廣泛的研究,比如由真菌Podosphaera fusc感染引起的白粉病。通過對(duì)感染白粉病的西葫蘆葉片進(jìn)行FluorCam多光譜熒光和熱成像分析,發(fā)現(xiàn)多光譜熒光參數(shù)F520/F680對(duì)于識(shí)別白粉病特別靈敏。這也證明了多光譜熒光非常適用于類似的植物表型研究(Pineda, 2017)。

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    圖5. 感染白粉病的西葫蘆葉片:(a)RGB成像;(b)熱成像;(c)多光譜熒光F440成像;(d)多光譜熒光F520/F680成像

    3. 根系病害

    由于根系難以直接觀察和檢測(cè),因此根系病害具有一定的隱蔽性。往往在發(fā)現(xiàn)病害時(shí),其癥狀已經(jīng)發(fā)展到中后期。鱷梨根系感染白紋羽病Rosellinia necatrix,通過葉片的葉綠素?zé)晒獬上?、多光譜熒光成像、熱成像分析,發(fā)現(xiàn)病害造成的根系功能損失,能夠同步影響葉片的光合生理、次生代謝和氣孔功能。而葉綠素?zé)晒鈪?shù)甚至可以在癥狀發(fā)展前就指示出病害的發(fā)生。通過FluorCam多光譜熒光成像技術(shù)進(jìn)行的這一研究既發(fā)現(xiàn)了根系病害對(duì)植物整體生理功能和地上部表型的影響,也為根系病害提供了早期檢測(cè)工具(Granum, 2015)。

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    圖6. 感染白紋羽病的鱷梨:左:地上部RGB圖;右:葉綠素?zé)晒?、多光譜熒光與熱成像圖

    4. 種子病害

    間座殼屬Diaporthe/擬莖點(diǎn)霉屬Phomopsis病原菌復(fù)合體是一類大豆種傳性病原體。它會(huì)首先感染大豆種子并以休眠菌絲的形態(tài)存活。而隨著大豆的萌發(fā)和生長(zhǎng),它就會(huì)造成大豆種腐病等嚴(yán)重病害。

    阿根廷布宜諾斯艾利斯大學(xué)嘗試使用不同的非熱等離子體Non-thermal plasma處理間座殼屬Diaporthe/擬莖點(diǎn)霉屬Phomopsis病原菌復(fù)合體侵染的大豆種子,然后對(duì)種子萌發(fā)和營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)狀況進(jìn)行評(píng)估,從而確定這種種子病害消毒方法是否理想——既能控制病害,又不會(huì)對(duì)大豆的營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)造成不利影響。FluorCam葉綠素?zé)晒?、FluorCam多光譜熒光成像、熱成像等都為這一研究提供的重要的數(shù)據(jù)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),非熱等離子體處理后的感染大豆,其光合能力與健康植株基本相同。而比起未進(jìn)行處理的大豆,其生長(zhǎng)狀況甚至有所提高(Pérez-Pizá, 2019)。

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    圖7. 左:不同感染狀況和處理后的大豆幼苗;右:大豆的RGB成像、熱成像、多光譜熒光成像

    參考文獻(xiàn):

    1. Chaerle L, et al. 2006, Multi-color ?uorescence imaging for early detection of the hypersensitive reaction to tobacco mosaic virus, Journal of Plant Physiology, doi:10.1016/j.jplph.2006.01.011

    2. Pineda M, et al. 2008, Multicolor Fluorescence Imaging of Leaves—A Useful Tool for Visualizing Systemic Viral Infections in Plants, Photochemistry and Photobiology, 84: 1048-1060

    3. Sandmann M, et al. 2017. The use of features from fluorescence, thermography and NDVI imaging to detect biotic stress in lettuce. Plant Disease, doi: 10.1094/PDIS-10-17-1536-RE

    4. Pineda M, et al. 2018. Detection of bacterial infection in melon plants by classification methods based on imaging data. Front. Plant Sci. 9(164), doi: 10.3389/fpls.2018.00164

    5. Pérez-Pizá MC, et al. 2019. Improvement of growth and yield of soybean plants through the application of non-thermal plasmas to seeds with different health status. Heliyon 5: e01495

    6. Granum E, et al. 2015. Metabolic responses of avocado plants to stress induced by Rosellinia necatrix analysed by fluorescence and thermal imaging. Eur J Plant Pathol, DOI 10.1007/s10658-015-0640-9

    7. Pineda M, et al. 2017. Use of multicolour fluorescence imaging for diagnosis of bacterial and fungal infection on zucchini by implementing machine learning. Functional Plant Biology

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