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    藻類表型分析技術應用案例二

    發(fā)布時間: 2020-10-13  點擊次數(shù): 1582次

     

    表型(Phenotype)是基因組(Genome)和環(huán)境(Environment)共同作用的結果,近年來,隨著高通量測序技術的快速發(fā)展,基因組的研究更加簡單快速,然而由于植物表型本身的復雜性以及動態(tài)變化的特性,表型研究滯后于基因組研究[1]。目前表型研究主要集中在植物/作物領域,在藻類領域,表型組學研究剛剛起步,但發(fā)展速度極為迅猛。

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    藻類表型組學需要全面分析藻類的表型特征,尤其是光合生理、形態(tài)、顏色、色素組成與分布、不同色素的光合貢獻、脅迫生理等方面的測量與分析,使藻類表型數(shù)字化、生理生態(tài)及功能可視化,這就需要針對藻類表型專門設計的技術解決方案。

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    易科泰為中國海洋大學設計的模塊式藻類表型分析系統(tǒng)

    表型易受外界環(huán)境(Environment)影響,相同細胞、組織和個體在不同環(huán)境下均存在著差異[2]。衣藻常見的培養(yǎng)方式是液體培養(yǎng)基和光照培養(yǎng),然而在瓊脂板和黑暗環(huán)境下衣藻也可以生長[3],科學家們?yōu)榱搜芯坎煌囵B(yǎng)環(huán)境下衣藻的基因表達,根據(jù)培養(yǎng)基狀態(tài)和光照條件設計了正交實驗,MC 1000多通道藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測系統(tǒng)具備同時單獨控制8組實驗的環(huán)境條件,成為了此研究的*,其研究成果發(fā)表于《PLOS ONE》。

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    Bogaert,2018

    光合作用是光合生理研究的熱點,葉綠素熒光測量技術作為植物光合作用研究的探針[4],目前已涵蓋細胞亞細胞水平、個體乃至群落水平,是表型研究的有力工具。煙臺大學的研究者,在《Environmental Science and Pollution Research》發(fā)表了“氮源和N/P對入侵強壯硬毛藻(Chaetomorpha valida)生長和光合作用的影響 [5] ”,研究人員使用AquaPen手持式葉綠素熒光測量儀測量了FV/FM,為防治強壯硬毛藻入侵提供可行性方法。

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    Chen,2020

    生物和非生物脅迫可導致產量和品質下降,是表型研究的重要方向[6],中國海洋大學研究者使用FluorCam多光譜熒光成像系統(tǒng)研究條斑紫菜(Pyropia yezoensis)感染赤腐病后的次生代謝響應,為揭示藻類抗逆適應機理、培育高質量藻種提供理論依據(jù)[7]。

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    Tang L,2019

    易科泰提供藻類表型分析全面技術方案:

    l FMT150/MC1000/ET-PSI藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測

    l AquaPen/FL6000藻類葉綠素熒光測量儀

    l Fluorcam葉綠素熒光/多光譜熒光成像

    l FKM多光譜熒光動態(tài)顯微成像系統(tǒng)

    l SpectraPen/PolyPen、Specim高光譜測量技術

    參考文獻:

    [1] 楊有新, et al. "植物表型組學研究進展." 江西農業(yè)大學學報 v.37;94.06(2015):164-171.

    [2] Kliebenstein, D. J. . "Secondary metabolites and plant/environment interactions: a view through Arabidopsis thaliana tinged glasses." Plant Cell & Environment 27.6(2010):675-684.

    [3] Bogaert, Kenny A. , et al. "Surprisal analysis of genome-wide transcript profiling identifies differentially expressed genes and pathways associated with four growth conditions in the microalga Chlamydomonas." Plos One 13.4(2018):e0195142.

    [4] Hai-Yan, Cen, et al. "葉綠素熒光技術在植物表型分析的研究進展." 光譜學與光譜分析 38.012(2018):3773-3779.

    [5] Li-Hong, Chen , et al. "Effects of nitrogen source and N/P on growth and photosynthesis in the invasive marine macroalga Chaetomorpha valida." Environmental Science and Pollution Research 4(2020).

    [6] Tardieu F, Simonneau T, Muller B. The Physiological Basis of Drought Tolerance in Crop Plants: A Scenario-Dependent Probabilistic Approach[J]. Annu Rev Plant Biol, 2018, 69(1), 733-759.

    [7] Tang, Lei , et al. "Transcriptomic Insights into Innate Immunity Responding to Red Rot Disease in Red Alga Pyropia yezoensis." International Journal of Molecular ences 20.5970(2019).